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斑马鱼神经递质系统与哺乳动物高度保守，兼具繁殖快、成本低、适合高通量筛选等优势，是抑郁症机制研究与抗抑郁药物筛选的经典模式生物。通过慢性应激可诱导斑马鱼出现活动减少、快感缺失、焦虑升高、社交与探索能力下降等抑郁样表型，高度模拟人类抑郁症核心症状。
斑马鱼凝血、血管、血栓细胞通路与人高度保守，凝血、血小板聚集机制贴近人类，是血栓与抗栓药物优选模型。采用 AA、三氯化铁、胶原复合肾上腺素诱导血管损伤、血小板活化形成血栓；检测血栓、血流、凝血相关指标，可评价样品抗血栓、护血管、改善循环功效。
斑马鱼脂质代谢、血管发育与人同源，高脂 / 高胆固醇诱导脂质紊乱构建动脉粥样硬化模型，血管易出现脂质斑块、炎症与氧化应激；检测血管脂沉积、血脂、氧化炎症指标，可评估受试物调脂、抑制血管斑块、抗动脉粥样硬化及心血管保护活性。
模型提供两种脂肪肝造模手段：高脂饲喂诱导饮食型脂肪肝；四氯化碳、硫代乙酰胺染毒损伤肝细胞，构建化学性脂肪肝。幼鱼通体透明，可直观观察肝脂变性、肝损伤及氧化炎症，评价样品保肝降脂、干预脂肪肝功效。
斑马鱼肝脏、乙醇代谢通路与人同源，乙醇浸泡构建酒精脂肪肝模型，模拟饮酒肝脂堆积、炎症肿大；幼鱼透明可活体观测肝脏脂滴，用于快速筛选解酒护肝活性物质。
肿瘤进展受凋亡、VEGF、Wnt、ALK 等通路调控，斑马鱼相关信号通路与人高度保守。幼鱼无成熟特异性免疫，可异种移植人源肿瘤细胞；搭配荧光标记可直观观察肿瘤增殖、侵袭转移，适合高通量筛选广谱及靶向抗肿瘤活性物质。
阿尔茨海默病以 β 淀粉样蛋白沉积、胆碱能神经损伤、认知记忆衰退为核心病理特征。斑马鱼神经调控与淀粉样蛋白代谢通路高度保守，适用于神经退行性疾病研究。氯化铝染毒可诱导斑马鱼脑内淀粉样蛋白蓄积、胆碱能系统损伤，引发学习记忆障碍。通过行为学检测趋光、趋避及应激反应，可快速评价受试物改善认知、抗阿尔茨海默病的体内活性。
斑马鱼免疫系统与哺乳动物高度保守，损伤后可依次募集中性粒细胞、巨噬细胞参与炎症应答。其鱼鳔在结构与免疫微环境上同源于哺乳动物肺，可模拟细菌性肺炎气道损伤与炎性浸润。利用 LPS 内毒素可诱导斑马鱼肺部炎症反应，结合中性粒细胞荧光转基因鱼，可直观观测炎性细胞募集分布，适用于抗炎、肺部保护活性物质的筛选评价。
斑马鱼前肾与高等脊椎动物高度保守，源自中胚层，含一对肾单位；48 hpf 肾小球具备滤血功能，96 hpf 形成与人相近的完整滤过膜，足细胞足突、肾小球滤过屏障结构同源，2 dpf 肾小管发育成熟。
花生四烯酸（AA）可调控血栓稳态：通过合成血栓素TXA₂促进血小板聚集，亦可生成前列环素PGI₂拮抗血栓形成。动脉粥样硬化与血栓病症，核心机制为血管壁PGI₂合成减少、血小板TXA₂合成异常升高。斑马鱼具备完整凝血因子与血小板受体，且对抗血栓药物响应良好，适用于血栓发病机制研究及抗血栓候选药物活性评价。
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